В "Междузвездни войни: Войните на клонираните" броят на джедаите, които се борят да запазят свободата и да възстановят мира в галактиката, все повече намалява. Те използват армията си от генетично създадени клонинги срещу привидно непобедимата армия от дроиди на Сепаратистите. Ужасяващият конфликт се разраства, когато нашите герои се впускат във войната, докато злият Граф Дуку, неговата придворна убийца Асадж Вентрес, техният господар Дарт Сидиъс и роботът Генерал Грийвъс планират да ги сразят.